פרופ' יוג'ין קנציפר קיבל תואר שלישי בפיסיקה עיונית (בהצטיינות) מאוניברסיטת בר אילן בשנת 1997. עבודת הדוקטורט שלו זכתה בהכרה של הקרן "יד הנדיב" אשר העניקה ליוג'ין את מלגת רוטשילד המיועדת לחוקרים צעירים מצטיינים ובעלי פוטנציאל יוצא דופן.
בשנת 2003 –לאחר שש שנים של פוסט דוקטורט במרכז הבינלאומי לפיסיקה תיאורטית בטריאסט (איטליה), באוניברסיטת קיימבריג' (בריטניה) ובמכון וייצמן למדע –הצטרף יוג'ין קנציפר לפקולטה למדעים כמרצה בכיר. משנת 2018 הוא קודם לדרגה של פרופסור מן המניין בפיסיקה מתמטית במחלקה למתמטיקה שימושית. בעשור האחרון מתעניין פרופ' יוג'ין קנציפר בהיבטים אינגרביליים של תורת המטריצות האקראיות בפרט ושל תורת הכאוס הקוונטי בכלל.
